Andalucía muestra su modelo de vigilancia genómica en Túnez

La Consejería de Presidencia, Sanidad y Emergencias de la Junta de Andalucía ha presentado en el 16º Congreso Global de Identificación Microbiana (GMI16), que se celebra en Túnez los días 24 y 25 de septiembre, su innovador sistema SIEGA (Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía). Esta plataforma, desarrollada desde 2020, se basa en la secuenciación del genoma completo para la vigilancia de enfermedades infecciosas y cuenta ya con más de 11.600 secuencias propias.

SIEGA, impulsada por la Secretaría General de Salud Pública y Promoción de Salud, integra actualmente 11.681 secuencias genómicas, que corresponden a once patógenos y otros agentes bajo vigilancia. Entre estos se encuentran bacterias causantes de enfermedades transmitidas por alimentos, como Salmonella, Listeria y Campylobacter; agentes ambientales como Legionella; así como patógenos clínicamente relevantes como Mycobacterium tuberculosis. Además, SIEGA también supervisa el VIH, acumulando más de 7.400 secuencias desde 2012.

Sistema avanzado para la detección epidemiológica

A las secuencias generadas por Andalucía se suman las aportadas por la Generalitat de Catalunya y la Generalitat Valenciana, así como por la Agencia Española de Seguridad Alimentaria y Nutrición (AESAN), superando así las 12.800 secuencias integradas en esta red conjunta.

La técnica empleada en SIEGA permite comparar cientos o miles de genes entre cepas bacterianas, lo que facilita determinar si dos muestras son idénticas o muy similares. Esto es crucial para identificar cadenas de transmisión activa o simplemente cepas del mismo serotipo sin relación epidemiológica. Así, el sistema contribuye a detectar agrupaciones de casos que no serían evidentes mediante métodos tradicionales.

Un enfoque integral hacia la salud pública

SIEGA utiliza una metodología llamada tipificación multilocus del genoma central (cgMLST), que genera alertas al identificar grupos de cepas genómicamente idénticas o muy cercanas. Esto proporciona información valiosa para orientar investigaciones epidemiológicas sobre posibles brotes.

Bajo el enfoque conocido como One Health, este modelo permite establecer conexiones entre casos clínicos humanos y fuentes animales o alimentarias, facilitando así una investigación más rápida y efectiva ante brotes epidémicos.

Expansión del modelo andaluz a nivel nacional

Nacido como un proyecto piloto en 2019, SIEGA comenzó su actividad operativa en 2020. Su diseño contempla una plataforma compartida donde cada organismo participante mantiene el control sobre sus propios datos.

Desde entonces, la Generalitat de Catalunya ha activado su dominio en 2024 con más de 600 secuencias aportadas, mientras que la Comunitat Valenciana se unió en 2025 con más de 570 secuencias. En 2026, AESAN también activó su propio dominio para la vigilancia genómica relacionada con la seguridad alimentaria a nivel nacional.

Andalucía comparte su experiencia internacionalmente

La experiencia andaluza se presenta en el GMI16, un congreso internacional que reúne a expertos y organismos relevantes en identificación microbiana. Este evento cuenta con la participación de instituciones destacadas como la Administración de Alimentos y Medicamentos de Estados Unidos (FDA) y los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC).

Bajo el título “Secuenciación del genoma completo: SIEGA, la experiencia andaluza. Del ámbito local al ámbito nacional”, se abordarán aspectos clave del sistema, incluyendo su evolución numérica y los desafíos futuros relacionados con la participación del sector privado y la interoperabilidad con sistemas europeos.

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